東京、大阪、京都相繼發(fā)生殺人事件，5名死者皆是被頭戴面具的黑影人用武士刀和弓箭瞬間殺害。警方介入調(diào)查，發(fā)現(xiàn)死者都是出沒(méi)于3地專門偷竊有名的佛像及美術(shù)品的偷盜集團(tuán)“源氏螢”成員。該集團(tuán)共有成員8名，以義經(jīng)的家臣名字互相稱呼，且都持有一本《義經(jīng)記》，被害5人手中的《義經(jīng)記》均被拿走。這日京都古寺山能寺收到奇怪書信，說(shuō)若能解開信中所附的畫謎，便能找到8年前被竊的如來(lái)佛像。柯南、小蘭隨毛利小五郎來(lái)到該寺，均對(duì)畫謎一籌莫展。5名被殺者之一曾對(duì)與新一不相上下的大阪高中生服部平次照料有加，服部也來(lái)到京都對(duì)案件秘密展開調(diào)查，并借機(jī)找尋自己的初戀情人。柯南與服部相遇聯(lián)手調(diào)查時(shí)，發(fā)現(xiàn)有人想置服部于死地，緊接“源氏螢”另一成員被害，而這一切，似乎又都與畫謎有關(guān)。